After announced by U.S. President Barack Obama strategy must change the terrorist organization "Islamic State" (IS, formerly ISIS) is now expected in Syria with U.S. air attacks. So far,

After announced by U.S. President Barack Obama strategy must change the terrorist organization "Islamic State" (IS, formerly ISIS) is now expected in Syria with U.S. air attacks. So far, the U.S. Air Force has the Sunni extremists bombed only in Iraq but in Syria left unmolested. In addition, the U.S. government wants to force as moderate rebels more than before upgrade and train for the fight against IS. As many partners from NATO and the Middle East to support the action. This involves According to experts, in the case of Syria only to fighting terrorism - and not a solution for the three and a half years of conflict. 

Obama wants to push back the IS-impact, without too deeply entangled in the Syrian civil war, according to Julien Barnes-Dacey of the think tank European Council on Foreign Relations (ECFR). U.S. air strikes should help moderate the rebels though, to stand up to the far most superior IS organizations. Support for this rebel that would change the balance of power against both the IS and to the regime of Bashar al-Assad was, however, not planned. "There is no comprehensive strategy to help the rebels a decisive victory in Syria," said Barnes-Dacey in the DW-conversation. Unlike in Iraq, the United States wanted to stay at a distance as possible in Syria. Reason for this is that Obama is the fragmented and weakened opposition not zutraue a real victory. 

Help for rebels as a gesture 

The announced military aid is the Swedish Syria experts Aron Lund that inter alia a political gesture. With this support, the Obama seeks the consent of Congress, let him turn to the Americans and the insurgents. "This is to show that he not only bombed the page, but also against Assad is going on," Lund says the Obama speech. The President had stressed:. "In the fight against IS we can not rely on one-Assad regime that terrorized his people, a regime that will never regain its lost legitimacy us" An action against the Syrian leadership he has, however, not indicated. 

  An IS-fighter waves a flag over a captured Syrian fighter aircraft (Photo: AP) 

Two and a half weeks ago conquered IS Fighter Syrian military airport Tabka 

The Syrian National Coalition (SNC) as umbrella organization for moderate forces welcomed the announcement of Obama. Whether U.S. air attacks would the SNC and Free Syrian Army's really come on IS-benefit objectives, however, is open. In the struggle between the Assad regime, the "Islamic State" and other rebel groups, the Assad troops could be beneficiaries. If the growing pressure of the IS-terrorist militia subsides on the regime, the more this forces has released for the fight against the moderate opposition. "That's probably good for Assad," Lund assess the possible air strikes against IS. The Syrian president would also exploit these attacks for its propaganda. "That helps him to present himself as the protector of the West against terrorism," says Lund. If the United States, the IS-militia bombed instead of the Syrian government forces, the show, who is regarded as the real threat to the West. 

Hardly expected protest against U.S. action 

Already in August 2013, after the use of chemical weapons in the vicinity of Damascus, seemed US air attacks possible in Syria. At that time, however, positions of the regime had been targeted. President Obama had previously defined the use of chemical weapons as a "red line." If this would be exceeded, Washington originally wanted to intervene. For an intervention to, Russia had then protested. Moscow is allied with Damascus and has blocked several resolutions of the UN Security Council on Syria with his veto. The USA finally renounced attacks. A broad diplomatic front against a U.S. intervention not expect Barnes-Dacey in the case of Terrorganisation IS: "There is an international consensus on the threat posed by the 'Islamic state'." 

  A soldier of the Free Syrian Army in front of a tank in Deir el-Zor in June 2013 (Photo: Reuters) 

The rebels of the Free Syrian Army always inspect fewer cities in Syria 

The ECFR expert criticizes Obama mainly from the perspective of counterterrorism on Syria look: "As long as the political reasons for the growth of the 'Islamic state' are not addressed, you can not get to the root of the problem." However, Washington seems to be missing in addition to a clear strategy and the force for a solution to the Syrian war. "This is another attempt by the USA to manage the conflict in Syria, but not to resolve it," Lund judgment on Obama's rate against IS. "I doubt that the United States are currently prepared to take economically, politically and militarily on themselves."

Are countries like Saudi Arabia, Qatar and Egypt really trusted partner in the fight against the murderous gangs of the "Islamic state" (IS)? No, they are not. Saudi Arabia has even a brutal and deeply

Are countries like Saudi Arabia, Qatar and Egypt really trusted partner in the fight against the murderous gangs of the "Islamic state" (IS)? No, they are not. Saudi Arabia has even a brutal and deeply undemocratic system of government based on the sharia. Qatar massively supported the Muslim Brotherhood in the region - including militant groups such as Hamas. Although Egypt again fought rigorously the Muslim Brotherhood, can be more radical groups like the Salafists, however, always run free so as not to alienate its most important donors in Saudi Arabia. 

In particular, had the "Sunni axis" from Gulf States and Turkey for a long time no problem at all with the terrorists of the IS. You can grant IS aware and at least indirectly even supported as long as they saw the terrorists a useful tool in the fight against the regime of Bashar al-Assad in Syria. For Assad is known ally of Shiite Iran, the Sunni Saudi Arabia bitterly vying for regional supremacy for many years. 

Sunni states could provide long IS 

Even as the fanatics of the IS overran the city of Mosul and their reign of terror stretched over large parts of Iraq, the Sunni States initially remained remarkably passive. For it was obvious that the terrorists had allied themselves with local Sunni groups against the former, Shiite-dominated government in Baghdad, which was the same as the Syrian regime closely tied in with the Iranian regime. This development they would not oppose prematurely. To overthrow the hated Shiite Prime Minister Nuri Al-Maliki, the Sunni states was evidently important at this time, as the IS-terrorists to halt. 

  German wave Rainer Sollich Arab editors 

Rainer Sollich, Arab department of Deutsche Welle 

Nevertheless, the alliance of the United States with the Sunni states is no alternative. Without their support, the fight against IS not win. Even if the IS can be financed by smuggling and forced taxes well even now, it remains important to dry out the private financial sources of terrorists, particularly in the Gulf region. The United States also need to use and overflight rights in the region in order to attack the terrorists in Iraq and in the future in Syria effectively. Even the military intervention itself is no alternative. Where all the people groups should be exterminated and innocent people beheaded in front of cameras with inhuman malice, can be countered only by force. 

What price must be paid? 

The participation of the Arab regimes will be but not for free. You will work with all means that neither Iran nor the regime in Syria are strengthened through struggle against IS. In the case of Syria, however, this is also a legitimate concern: This system results in more than three years, an inhuman war against much of his own people and should not emerge as a profiteer from the fight against terrorism. It is therefore right at all uncertainties, the United States has decided in parallel with military operations against IS in Syria, a direct military support for moderate Syrian regime opponents. Whether this plan will rise so, however, is uncertain. Assad might end up going as a win. 

Another prize is political: the Arab states arms is acutely aware of how much Washington is instructed in the current conflict situation to them. Criticism of human rights violations if they will ever even uttered loudly, they will continue to reject with the utmost confidence. In times of anti-terror fight will soon be seeing certainly no other "Arab Spring" more - and therefore not necessary renewal of political regimes crusted.

Washington. USA see signs that Russia complies Minsk agreements ceasefire in Ukraine, said White House spokesman Josh Earnest, RIA Novosti

Washington. USA see signs that Russia complies Minsk agreements ceasefire in Ukraine, said White House spokesman Josh Earnest, RIA Novosti. 

He also confirmed that the United States is ready to withdraw its sanctions against Russia in case of compliance agreements Minsk from Moscow. 

"These are the first impressions and do not want to fall into euphoria. United Russia expect further moves in this direction, "said Ernest.

English: Russian director Boris Khlebnikov in a press conference Русский: Российский режиссёр Борис Хлебников на пресс-конференции «Киносоюза» (Photo credit: Wikipedia)

Casey Kasem, que entretuvo a los oyentes de radio durante casi cuatro décadas como el anfitrión de la cuenta atrás muestra como

Photo taken at the 41st Emmy Awards 9/17/89 - Permission granted to copy, publish or post but please credit "photo by Alan Light" if you can. (Photo credit: Wikipedia)

Publicado: Dom, 15 de junio 2014 11:02:52 EDT
Casey Kasem, que entretuvo a los oyentes de radio durante casi cuatro décadas como el anfitrión de la cuenta atrás muestra como "American Top 40" y "de Casey Top 40", falleció la madrugada del domingo, según una publicación en Facebook de su hija Kerri Kasem.
Bombas Pakistán escondites militantes
Publicado: Dom, 15 de junio 2014 05:38:50 EDT
Aviones militares paquistaníes dirigidos escondites en el noroeste, cerca de la frontera con Afganistán, la madrugada del domingo, matando al menos a 50 presuntos terroristas.
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Publicado: Dom, 15 de junio 2014 08:33:51 EDT
Un soldado de EE.UU. que sirve décadas en la cárcel por filtrar documentos a WikiLeaks rompió su silencio en una editorial de fuego acusando a Estados Unidos de mentir sobre Irak.
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49 muertos como avión derribado
Publicado: Dom, 15 de junio 2014 02:14:27 EDT
Un avión militar ucraniano fue derribado, matando a las 49 personas a bordo, dijo un portavoz.
Bomba de carretera mata a 11 en Afganistán
Publicado: Dom, 15 de junio 2014 07:18:17 EDT
Una bomba mató a 11 personas en Afganistán, entre ellos tres trabajadores electorales, dijeron las autoridades el domingo.
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Publicado: Dom, 15 de junio 2014 11:54:18 EDT
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California está siendo golpeado duro con una epidemia de tos ferina, de acuerdo con el departamento de salud pública del estado, con 800 casos reportados en las últimas dos semanas.
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Publicado: Sab, 14 de junio 2014 12:05:57 EDT
El toque de queda nocturno impuesto en Tailandia tras el golpe militar del mes pasado ha sido levantada, dijo el general Prayuth Chan-ocha durante su discurso semanal de los viernes.
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CNN Victor Blackwell informa sobre un ataque a dos sacerdotes en Phoenix que dejó un muerto y otro hieren de gravedad.
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Publicado: viernes, 30 de mayo 2014 11:22:39 EDT
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marcha para jesus 2012

Stained glass at St John the Baptist's Anglican Church http://www.stjohnsashfield.org.au, Ashfield, New South Wales. Illustrates Jesus' description of himself "I am the Good Shepherd" (from the Gospel of John, chapter 10, verse 11). This version of the image shows the detail of his face. The memorial window is also captioned: "To the Glory of God and in Loving Memory of William Wright. Died 6th November, 1932. Aged 70 Yrs." (Photo credit: Wikipedia)

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Marcha para Jesus 2014

English: Jesus Christ - detail from Deesis mosaic, Hagia Sophia, Istanbul (Photo credit: Wikipedia)

Marcha para Jesus 2014

¿Qué está haciendo Vodafone revelan espionaje acceso solicitado por la India, otros gobiernos

¿Qué está haciendo Vodafone revelan espionaje acceso solicitado por la India, otros gobiernos
Gobierno husmeando en las redes de telefonía es muy amplia en todo el mundo, una de las mayores compañías de telefonía celular del mundo reveló el viernes, diciendo que varios países exigen un acceso directo a sus redes sin orden judicial ni previo aviso.
El informe detallado de Vodafone, que cubre los 29 países en los que opera en Europa, África y Asia, proporciona la visión más completa hasta la fecha de cómo los gobiernos monitorean las comunicaciones de telefonía móvil.
India fue uno de los países que buscaban el acceso a la red de Vodafone para interceptar llamadas, mensajes de texto y correos electrónicos el año pasado, dijo el grupo con sede en Reino Unido. Pero la mayor de las telecomunicaciones no reveló si se cumplió con las peticiones de la India.
HT fue el primero en reportar el 10 de marzo que el Ministerio de Finanzas de la Unión había pedido al Departamento de Telecomunicaciones para examinar la posibilidad de Vodafone compartir detalles de las llamadas telefónicas y correos electrónicos con la agencia de seguridad británica Sede de Comunicaciones del Gobierno.
El informe del comandante de telecomunicaciones asciende a una convocatoria de un debate sobre el control de las comunicaciones, ya que las empresas se preocupan cada vez más por ser visto como digno de confianza.
Leer: India entre 29 países que procuraron acceso para aprovechar las llamadas, dice Vodafone
Escuchas telefónicas de los teléfonos y el acceso a los registros de llamadas para fines de orden público es una práctica de décadas de antigüedad y aceptado, incluso en las democracias más abiertas. Con el respaldo de los tribunales, la policía puede solicitar la cooperación de las compañías telefónicas, una valiosa herramienta para la búsqueda de los criminales.
Pero la revelación más explosiva en el informe de Vodafone es que en seis países, las autoridades requieren acceso directo a la red de un operador - pasando por alto las sutilezas legales, como los warrants y eliminando la necesidad de conseguir la cooperación caso por caso de los empleados de la compañía telefónica.
No nombrar a los países por razones legales y para proteger a los empleados que trabajan allí.
"En esos países, Vodafone no recibirá ningún tipo de demanda de acceso de interceptación legal como a los organismos y autoridades competentes ya tienen acceso permanente a las comunicaciones de los clientes a través de su propia conexión directa", dijo el informe.
Leer: Vodafone dice govts tienen acceso directo a espiar en algunos países
Vodafone no quiso decir que los países han establecido estos vínculos directos. Pero en un apéndice exhaustivamente investigado el informe, la compañía arrojó luz sobre los marcos legales que rodean a la interceptación del gobierno en los 29 países.
En el anexo se revela que seis países - Albania, Egipto, Hungría, Irlanda, Qatar y Turquía - tienen disposiciones que permiten a las autoridades para solicitar el acceso sin trabas.
En otros dos países, India y el Reino Unido, las disposiciones legales no son claros en cuanto a si los funcionarios del gobierno se les permite tener acceso directo, según el informe.
El informe de Vodafone se produce un año después de analista antiguos sistemas NSA Edward Snowden reveló que las agencias de inteligencia de Estados Unidos y de otros países de manera rutinaria e indiscriminadamente recogen y almacenan grandes cantidades de datos de llamadas telefónicas y comunicaciones de internet.
Las revelaciones han centrado especial atención en el papel de las empresas de tecnología y telecomunicaciones occidentales, que están acusados ​​de facilitar la vigilancia masiva dando espías acceso sin restricciones a sus redes.
Lea: DID datos de fugas Vodafone a la agencia de espionaje del Reino Unido? India lanza la sonda
Ya que varias empresas de Silicon Valley han tratado de restablecer la confianza de los consumidores mediante la publicación de datos sobre la vigilancia del gobierno.
Pero las compañías de telecomunicaciones se encontraron en una posición aún más incómoda. Históricamente más cerca de los gobiernos, ya que muchos fueron una vez propiedad del Estado, las empresas de telecomunicaciones son mucho más fuertemente regulado y tienen empleados en la planta - que sean más sensibles a las demandas del gobierno para los datos.
Al hacer público su informe, junto con un desglose de las solicitudes de información, Vodafone tomó la inusual decisión de entrar en el debate internacional sobre el equilibrio de los derechos de la privacidad contra la seguridad.
En lugar de ser atrapado con la responsabilidad y la reacción de los consumidores cuando los consumidores se dan cuenta de que sus datos se recogió sin su conocimiento, empresas como Vodafone han decidido que es hora de impulsar un debate.
"Las empresas están reconociendo que tienen la responsabilidad de divulgar el acceso del gobierno", dijo Daniel Castro, analista senior de la Fundación Tecnologías de la Información e Innovación en Washington, DC. "Esto es nuevo".
El estudio llega en un momento en que otras empresas también están pidiendo una renovación de las leyes demasiado anticuadas para hacer frente a la rápida evolución de las telecomunicaciones universo.
Los ejecutivos de Silicon Valley, por ejemplo, han aumentado la presión sobre el presidente Barack Obama para frenar los programas de vigilancia del gobierno EE.UU. que recogen información de la Internet.
Twitter Inc., LinkedIn Corp., AOL Inc., Google Inc., Apple Inc., Yahoo Inc., Facebook Inc. y Microsoft Corp. están presionando para que los controles más estrictos sobre el espionaje electrónico-por temor a que el espionaje amenaza el sustento financiero de la industria de la tecnología.
"Ellos quieren que sus clientes puedan confiar en ellos para almacenar sus datos de manera privada y segura", dijo Castro.
Leer: Fallout de Snowden asunto aún mece EE.UU. un año después
El informe de Vodafone también es visto por algunos como un esfuerzo para pasar la página de papel vergonzoso de la compañía en las protestas que derrocaron al dictador egipcio Hosni Mubarak en 2011.
A medida que las protestas rabió, Vodafone bombardeado sus suscriptores egipcios con los mensajes de texto a favor del gobierno. En ese momento, la compañía dijo que no tenía más remedio que cumplir, pero fue duramente criticado por sus acciones. Un cambio en la cultura siguió.
"Se llevaron una dura lección allí", dijo Cynthia Wong, un investigador de Internet de Human Rights Watch. "Incluso si el gobierno es el problema último, se dieron cuenta que tenían que tomar medidas para limitar los daños a los usuarios."
Defensores de los derechos civiles aplaudieron Vodafone para liberar el informe, y las grietas abiertas al debate, como también ellos expresaron alarma por las infracciones a los derechos civiles.
"Para los gobiernos para acceder a llamadas telefónicas en el simple accionamiento de un interruptor no tiene precedentes y aterrador", dijo Shami Chakrabarti, director del grupo de derechos humanos de la libertad, y agregó que las revelaciones Snowden mostraron Internet ya estaba siendo tratado como "juego limpio".
"Bravatas que todo está bien es que llevaba bastante finas - nuestras leyes analógicas necesitan una revisión digital", dijo.
Aunque algunos de los gobiernos incluidos en el informe fueron capaces de bloquear la divulgación de cualquier aspecto de cómo se llevó a cabo la interceptación, el informe es único, ya que ofrece una visión de cómo los gobiernos llevan a cabo la vigilancia.
Aunque algunos de los operadores estadounidenses, como AT & T y Verizon, ofrecen información en medio de las acusaciones de Snowden, el nivel de detalle es minúsculo en comparación con el informe del viernes, dijo Wong. Defensores de los derechos civiles no fueron los únicos que aplauden las acciones de Vodafone. La noruega Telenor Group, que también tiene operaciones en Europa del Este y Asia, ofreció apoyo, teniendo en cuenta los gobiernos tienen la responsabilidad última para actuar.
Los países incluidos en el informe son los siguientes: Albania, Alemania, Australia, Bélgica, la República Checa, Congo, Egipto, Fiji, Francia, Alemania, Ghana, Grecia, Hungría, India, Irlanda, Italia, Kenya, Lesotho, Malta, Mozambique, Países Bajos , Nueva Zelanda, Portugal, Qatar, Rumania, Sudáfrica, España, Tanzania, Turquía y el Reino Unido.

Acelerar Antibody Descubrimiento

Instituto Nacional de Chile (1913) (Photo credit: Wikipedia)

Acelerar Antibody Descubrimiento
Los anticuerpos monoclonales han sido durante mucho tiempo potentes herramientas para la investigación básica, así como para el diagnóstico y tratamiento de la enfermedad. Tradicionalmente, los investigadores obtuvieron dichos anticuerpos de roedores utilizando la técnica desarrollada por premios Nobel Georges Köhler y César Milstein a mediados de la década de 1970 (Nature, 256:495-97, 1975). En este enfoque, los investigadores primero recogen las células productoras de anticuerpos a partir de ratones expuestos a un antígeno de interés y se fusionan a células de mieloma, formando los denominados hibridomas que pueden sobrevivir durante un largo tiempo en cultivo. Mediante un cribado células híbridas únicas para las que producen el anticuerpo de interés, los investigadores pueden desarrollar una línea celular generando cantidades prácticamente ilimitadas de anticuerpos altamente específicos.

Los anticuerpos derivados de animales, sin embargo, son problemáticos para su uso como agentes terapéuticos, debido a que las moléculas pueden activar respuestas inmunes en seres humanos. Para evitar este problema, los investigadores han desarrollado varios métodos diferentes para la obtención de anticuerpos que se producen de forma natural por las células inmunes humanas en respuesta a agentes patógenos o antígenos específicos. Una estrategia implica el aislamiento de células B de memoria humanos que han sido purificadas a partir de una muestra de sangre e inmortalizando ellos mediante la infección con el virus de Epstein-Barr, a continuación, la detección cultivos in vitro para los que generan anticuerpos con la especificidad deseada. "Esto ha sido de gran valor para muchos años, y los distintos laboratorios han hecho cosas para hacer de este un proceso más eficiente", dice Patrick Wilson, profesor asociado de inmunología en la Universidad de Chicago. "Pero es laborioso en el laboratorio, ya que hay que hacer todas estas líneas celulares, y tienes que defender muchas células." Por otra parte, no todas las células sobreviven al proceso de inmortalización, lo que limita el número de anticuerpos naturales que se pueden aislar utilizando como un enfoque.

Más recientemente, Wilson y otros han ideado formas para aislar células individuales, B específicas de antígeno a partir de la sangre de donantes humanos con respuestas inmunes activas contra un patógeno o vacuna en particular. Para cada célula aislada, que por separado clonar los dos genes que codifican las cadenas pesadas y ligeras que componen un anticuerpo, y que varían en secuencia de célula a célula. "Si usted no tiene tanto, usted no tiene un anticuerpo", dice Wilson. "Y no se puede mezclar sus células, porque obtendrá una cadena pesada de un celular y una cadena ligera de otra célula", y por lo tanto no puede terminar con una combinación natural de las cadenas pesadas y ligeras. Una vez que los investigadores han clonado los pares de genes-pesada y de cadena ligera que se encuentran de forma natural en las células, que pueden producir versiones recombinantes de cada anticuerpo en el laboratorio. Esta técnica, conocida comúnmente como la clonación de expresión ", es de gran alcance porque no estás de células B que se pueden aislar, en cualquier contexto alguno limitado, usted puede hacer un anticuerpo a partir de", dice Wilson. "El problema con esto es que hay un montón de pasos para cada celda para clonar los genes de anticuerpos."

Esta técnica es la mejor para "cuando se tiene una población enriquecida de antígeno-específica de células no-están allí, a excepción de un breve periodo de tiempo después de la vacunación o infección", dice Wilson. Sería extremadamente laborioso de usar esta estrategia para tratar de identificar un anticuerpo contra un antígeno de interés usando la sangre de una persona sin una respuesta inmune activa, dice, porque millones de células B de memoria están presentes en la sangre, cada uno de los cuales es únicamente específico para un antígeno diferente.

Aunque todos estos enfoques han sido valioso para la identificación de nuevos anticuerpos y la caracterización de las respuestas inmunes humanas, que son mucho tiempo y es complicada. Aquí, el científico habló con algunos expertos que están trabajando en nuevas formas de acelerar el descubrimiento y aislamiento de anticuerpos monoclonales.

Método cultura basada en la célula


Trazando el camino: las células B crecen en cultivo en pocillos individuales sobre una capa de células de alimentación, y los medios de cultivo de células se analiza para detectar la especificidad de unión de anticuerpos o actividad neutralizante. El uso de la PCR, los investigadores luego amplifican los genes de las cadenas pesadas y ligeras de anticuerpos de interés, clonar en vectores de expresión, y la secuencia de ellos. Los vectores de expresión se transfectan en células, y los anticuerpos resultantes se purifican y se prueban para la actividad.
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EL PERSONAL CIENTÍFICO
Usuario: Mark Connors, jefa de la Sección de VIH específica Inmunidad, Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas de los Institutos Nacionales de Salud, Bethesda, Maryland

Proyecto: Aislar nuevos anticuerpos ampliamente neutralizantes potentes contra el VIH

Problema: La inmortalización de células productoras de anticuerpos de los pacientes infectados con VIH puede ser ineficiente, e incluso cuando las células se inmortalizan con éxito, algunos clones tienden a ser inestables. Mientras que los investigadores anteriores han obtenido anticuerpos neutralizantes del VIH-el uso de sondas fluorescentes para sacar antígenos específicos de células B de memoria de una muestra de sangre, Connors y su equipo querían descubrir nuevos anticuerpos neutralizantes del VIH, sin limitarse sólo a aquellos que son específicos para antígenos conocidos.

Solución: Connors y su equipo primero utilizaron citometría de flujo para aislar las células B de un donante infectado por el VIH. Pero en lugar de la clonación de los anticuerpos genes pesados ​​y-cadena ligera de cada célula, como en una típica expresión de clonación de la configuración, el grupo de Connors distribuye las células aisladas en placas de 384 pocillos, donde las cultivaron en presencia de células alimentadoras y moléculas de señalización que ayudan a mantener vivas las células B y también estimulan a secretar anticuerpos. Después de dos semanas, los investigadores analizaron el sobrenadante de cada pocillo para su capacidad de neutralizar el VIH in vitro. Luego se clonaron los genes de anticuerpos de las células que producían sobrenadantes con actividad neutralizante y, finalmente, producen versiones recombinantes de los anticuerpos (Nat. Protoc, 8:1907-15, 2013). Usando este método, Connors y su equipo aislaron dos nuevos anticuerpos que neutralizan potentemente muchas cepas diferentes de VIH (Nature, 491:406-12, 2012).

Pros:

No requiere que los usuarios conocer la especificidad de unión de los anticuerpos que van después de
Aplicable a las porciones de diversas enfermedades. "Siempre y cuando usted tiene una función objetivo que se puede utilizar para la detección, que le permite sacar los anticuerpos", dice Connors.
El protocolo completo dura alrededor de tres semanas en completarse, dice Connors.
Las células de alimentación están disponibles gratuitamente a través del programa de reactivo SIDA.
Contras:

Los reactivos requeridos para ensayos de neutralización pueden ser costosos.
Aunque esta estrategia teóricamente se puede hacer a mano, el gran número de pozos que se deben defender-en el caso de Connors, tantos como 60,000-140,000-hace que esta técnica más susceptibles de laboratorios con equipos de manejo de líquidos robóticos.
Algunas células productoras de anticuerpos pueden no sobrevivir al proceso de cultivo.
Costo: Connors estima que su técnica cuesta aproximadamente $ 400 - $ 500 por placa de 384 pocillos. Dependiendo del rendimiento de las células B de una muestra de sangre, los investigadores probablemente utilizar cerca de 20 placas para un manual de puesta a punto, y 60 a 80 placas por un robot de configuración.

De alto rendimiento de secuenciación de ADN


RÁPIDO Y ESPECÍFICO: Identificar anticuerpos mediante secuenciación de ADN, las células B individuales se aislaron por primera vez en micropocillos y lisadas en presencia de microperlas magnéticas que capturan los ARNm-región variable de cadena pesada y ligera (VH y VL). Los ARNm son amplificadas por PCR usando cebadores que combinan las transcripciones VH y VL en un único amplicón de ADNc. Estos amplicones se secuenciaron a continuación, y métodos bioinformáticos se utilizan para identificar VH: pares VL. Estos genes VH y VL se clonan a continuación y se expresan en las células, seguido de la purificación del anticuerpo resultante.
Ver infografía completa: JPG | PDF
B. DeKosky Y G. GEORGIOU (imagen de la inserción); EL PERSONAL CIENTÍFICO
Usuario: George Georgiou, profesor de ingeniería química e ingeniería biomédica de la Universidad de Texas en Austin

Proyecto: Utilice secuenciación de alto rendimiento para descubrir, anticuerpos humanos nativos de antígenos específicos

Problema: En un artículo publicado en 2010, el grupo de Georgiou mostró que se podía utilizar la secuenciación de alto rendimiento de los genes de inmunoglobulina para producir rápidamente anticuerpos específicos de antígeno (Nat. Biotechnol, 28:965-69, 2010). El equipo simplemente generado anticuerpos recombinantes utilizando los genes pesados ​​y de cadena ligera que se expresaron de forma más abundante en las células productoras de anticuerpos de los ratones después de la inmunización. Sin embargo, la técnica no podía distinguir qué pares de los genes-pesadas y cadenas ligeras se expresaron originalmente por cada una de las células productoras de anticuerpos del animal. Por lo tanto, para reconstruir un anticuerpo nativo, Georgiou necesita una estrategia para secuenciar las cadenas pesadas y ligeras juntos.

Solución: el equipo de Georgiou utiliza primero citometría de flujo para purificar las células B de la sangre. Luego, los investigadores aislaron células individuales en los pozos 125 picolitros de una diapositiva, y se amplificaron porciones de las regiones variables de ambos los genes pesados-y-cadena ligera de cada célula, utilizando cebadores de PCR especializados que incorporan ambos fragmentos de genes en una sola pieza de ADN. Entonces utilizaron secuenciación de próxima generación para descifrar las secuencias de las hebras y enlaces de procesamiento de la bioinformática para analizar los pares de cadenas pesadas y ligeras. Usando este enfoque, se identificaron 86 pares únicos de cadenas pesadas y ligeras de las células productoras de anticuerpos de un donante humano que habían sido inmunizados con toxoide tetánico (Nat Biotechnol, 31:166-69, 2013). Cuando se producen 10 diferentes anticuerpos recombinantes utilizando las secuencias de 10 de los pares, encontraron que la totalidad de sus anticuerpos unidos toxoide del tétanos in vitro con alta afinidad. Por el contrario, los estudios anteriores han demostrado que sólo el 10 por ciento de los anticuerpos generados usando técnicas que se basan en el apareamiento aleatorio de los genes-pesadas y cadenas ligeras son antígeno-específica, dice Brandon DeKosky, un estudiante graduado en el laboratorio de Georgiou que ayudó para desarrollar la técnica.

Pros:

Muy rápido. "Usted puede ir de las células a las secuencias de cadena pesada y ligera humanos totalmente nativas dentro de una semana", dice DeKosky.
? Identifica las secuencias nativas de anticuerpos
Puede identificar inmunoglobulinas codificadas por clones de células B raras
También útil para el seguimiento del desarrollo de las células B durante la respuesta inmune
Contras:

Las diapositivas de micropocillos no están disponibles comercialmente, por lo que los usuarios tendrán que hacer su propio.
Los usuarios necesitarán un poco de experiencia en bioinformática para analizar las secuencias
Costo: DeKosky dice que su equipo gastó unos 550 dólares de los reactivos necesarios para obtener las secuencias de más de 2700 pares únicos de genes de anticuerpos de una muestra de células B.

Proteómica Minería


INTERROGATORIO INTEGRAL: Identificar anticuerpos por la minería proteómica, anticuerpos específicos de antígeno se purifica primero a partir de suero. Las proteasas digieren los anticuerpos en péptidos que son analizados por espectrometría de masas. Para identificar estos péptidos, una base de datos de referencia se genera mediante la secuenciación de los genes VH y VL a partir de células B aisladas de la misma muestra de sangre. Las combinaciones de secuencias VH y VL se clonan a continuación y se expresan en células para generar anticuerpos que se investigan luego respecto a su especificidad y actividad de unión.
Ver infografía completa: JPG | PDF
EL PERSONAL CIENTÍFICO
Usuario: Roberto Polakiewicz, director científico, Cell Signaling Technology, Inc., Danvers, Massachusetts

Proyecto: Identificar anticuerpos que están realmente presentes en el suero de los seres humanos y animales para producir versiones recombinantes de alta afinidad

Problema: Los anticuerpos generados por las estrategias de-sea a través de la inmortalización de las células B, la clonación de expresión, o basado en células no secuenciación-son representativas de las repertorio completo de anticuerpos que son realmente circulando en el suero in vivo. Eso es debido a que algunas células pueden morir durante el proceso de aislamiento, y los anticuerpos codificados por otros no pueden en realidad ser secretada a la circulación. "La razón por la que hacemos anticuerpos es combatir las infecciones", dice Polakiewicz, y por lo tanto, "lo que importa es lo que circula, porque esos son los anticuerpos que terminan encontrando los agentes patógenos y recordando otras células inmunitarias para deshacerse de ellos." Por tanto, , Polakiewicz y sus colegas querían desarrollar una estrategia para analizar directamente los anticuerpos que circulan en la sangre.

Solución: El equipo de Polakiewicz volvió a la proteómica. Se utilizó por primera vez la purificación por afinidad de aumentar las fracciones de anticuerpos específicos aislados a partir del suero de un donante que recientemente habían sido vacunados contra el virus de la hepatitis B. (Para más información sobre las estrategias para la purificación de anticuerpos, consulte "Pursuits puro" The Scientist, Mayo 2012). El equipo luego digiere estos anticuerpos con proteasas para generar fragmentos de péptidos y los analizó usando espectrometría de masas. Para interpretar los espectros de masas, los investigadores tuvieron que construir una base de datos de referencia a medida por la secuenciación de los genes de anticuerpos de las células del donante B. "No se puede utilizar todo el genoma", dice Polakiewicz. "Eso le dará secuencias de células B de la línea germinal, pero no las secuencias que fueron creadas de novo tras la inmunización."

Mediante la comparación de las secuencias de genes de inmunoglobulina con los espectros de masas de péptidos, el equipo de Polakiewicz fue capaz de identificar y clonar los genes pesados ​​y de cadena ligera que codifican los anticuerpos presentes en la muestra de suero y generar varios anticuerpos recombinantes que se unían con alta afinidad a la de la hepatitis antígeno del virus B (Nat. Biotechnol, 30:1039-43, 2012).

Pros:

Permite a los investigadores a analizar la composición de los anticuerpos presentes en la circulación humana
Podría ser utilizado para rastrear cambios en el repertorio de anticuerpos circulantes-a través del tiempo
Contras:

El software del equipo utilizado en el análisis bioinformático de las secuencias de péptidos y genes se desarrolló en la casa, por lo que los usuarios tendrán que crear su propia cuenta.
? Este enfoque altera el emparejamiento nativo de las cadenas pesadas y ligeras presentes en los anticuerpos en el suero.
? Se requiere una experiencia sustancial en la secuenciación y espectrometría de masas
? Trabajo intensivo. Toma alrededor de 21 días para generar anticuerpos monoclonales recombinantes funcionales.
Costo: Polakiewicz no pudo estimar el costo de la identificación de anticuerpos usando un enfoque basado en la proteómica, pero dice que probablemente cuesta lo mismo o un poco menos que una de las estrategias basadas en las células utilizadas.

De los resultados de la investigación a los historiales médicos electrónicos, los datos biomédicos son cada vez más accesibles.

English: Oracle Corporation headquarters, building 300, in Redwood Shores, Redwood City, California. (Photo credit: Wikipedia)

De los resultados de la investigación a los historiales médicos electrónicos, los datos biomédicos son cada vez más accesibles. ¿Cómo pueden los científicos mejor provecho de la avalancha de información? En febrero de 2013, la Oficina de Política Científica y Tecnológica de EE.UU. emitió un memorando a los departamentos y organismos que dirigen los que contribuyen con más de $ 100 millones anuales a la investigación para desarrollar un plan para aumentar el acceso del público a los federales los resultados del estudio. Los datos generados por la investigación financiada por el gobierno federal deben hacer "accesible públicamente para buscar, recuperar y analizar" la carta. El acceso equitativo a la Ley (FASTR) Ciencia e Investigación Tecnológica, presentado al Congreso el mismo mes, pretende codificar el mandato. La Comisión Europea ha recomendado de manera similar, y anunció que pronto exigirá que sus estados miembros pasan políticas para garantizar la accesibilidad digital de los datos de investigación financiados con fondos públicos.

Si bien se están cumpliendo estas iniciativas con cierta resistencia-las fronteras de la innovación, la Ley de Investigación, Ciencia y Tecnología (FIRST), por ejemplo, lo que limitaría el acceso público a los resultados de investigación financiados por el gobierno federal, también es actualmente haciendo su camino a través de los EE.UU. Congreso- hay un impulso claro para el intercambio generalizado de hallazgos de la investigación. Esta actitud ha llevado a la creación de repositorios de datos de más de 600 que permiten el intercambio entre la comunidad científica y, a menudo el público, con más de 200 de los que se centran en los datos de las ciencias de la vida. Muchas universidades e instituciones de investigación están poniendo en marcha sus propios repositorios, mientras que los datos clínicos de los centros de atención de salud, las grandes farmacéuticas, e incluso los propios pacientes también se están haciendo accesibles.

"Se está convirtiendo en más y más claro lo importante que es compartir", dice George Church de la Universidad de Harvard, que durante la mayor parte de la última década ha ayudado a ejecutar el acceso abierto Personal Genome Project (PGP), que alberga las secuencias de todo el genoma de más de 200 personas y rasgo de datos sobre miles más. "Hay más datos mejor."

Por desgracia, teniendo acceso a océanos de datos no es suficiente. Para recuperar información útil de este tipo de grandes conjuntos de datos, los investigadores también deben elaborar nuevos análisis y maneras creativas de hacer preguntas biológicas pertinentes. Algunas empresas han desarrollado las competiciones en línea que desafían a los participantes a desarrollar los mejores modelos de predicción de la enfermedad o para establecer normas de investigación. Otros esfuerzos tienen como objetivo la construcción de bienes comunes de datos que pueden ser analizados y se actualizan en tiempo real.

"En muchos sentidos, [los investigadores] utilizando la tecnología para acercar la ciencia detrás hacia la forma en que solía ser, donde estaba presente muy vital, la conversación que viven entre las mentes", dice Nathan Pearson, científico genoma director de Ingenuity (ahora una división de Qiagen ), en Redwood City, California, que ofrece herramientas basadas en web para la anotación funcional y la comparación de los datos genómicos y recientemente invitó a la comunidad en línea para ayudar a analizar los datos genómicos de pacientes miopía y controles sanos. "En el mismo sentido, creo que también es importante comenzar a acelerar la idea de la edición, la apertura de datos a la comunidad para la discusión de esta manera continua."

"Es muy duro para acelerar la investigación cuando usamos los métodos de comunicación que funcionan como si [estamos] hablando entre dos latas", coincide Stephen Friend, presidente y cofundador de Sage Bionetworks, una organización no lucrativa con sede en Seattle que proporciona infraestructuras para el intercambio de datos y se ejecuta competencias para extraer nueva información de los datos. "El objetivo [es] para poder cambiar la forma de hacer la investigación médica."

Comparte y compara

Algunos repositorios digitales se especializan en ciertos tipos de información, tales como genomas, plásmidos, o estructuras de proteínas. Otros, como figshare y Dryad, recoger todos los datos que los investigadores quieren subir. Mientras tanto, los pacientes están cada vez más dispuestos a compartir abiertamente información sobre sí mismos para la investigación y la adopción generalizada de registros electrónicos de salud está haciendo datos anónimos más ampliamente disponibles. "Es posible tener la investigación biomédica sucediendo de una manera abierta y colaborativa que tiene hasta ahora sido muy difícil de hacer", dice el amigo.

El año pasado, Sage unió fuerzas con el Diálogo para la ingeniería inversa Evaluaciones y Métodos (SUEÑO) para ejecutar "desafíos" que proporcionan a los investigadores una colección de datos y les pedimos que diseñar modelos de la progresión del cáncer, el desarrollo de normas para la identificación de mutaciones significativas o para encontrar biomarcadores para la detección precoz de la enfermedad, entre otros objetivos. Los desafíos que se ejecutan en una plataforma abierta que permite a los algoritmos que se compartan como se crean, invitando a otros equipos para mejorar los actuales campeones.

Otros grupos han diseñado desafíos de datos similares. En octubre pasado, los investigadores de Ingenuity iniciaron el análisis de colaboración abierta de 111 genomas completos del Proyecto Genoma Personal e invitaron a cualquier persona con una conexión a Internet para manipular los insumos básicos de un modelo de predicción de la miopía o la miopía. Aunque la compañía no ha recibido comunicaciones directas, sin embargo, la respuesta ha sido positiva, dice Pearson de Ingenuity. "[Es] señala el camino a lo que este tipo de datos se puede hacer", dice. "La cuestión hoy no es:" ¿Qué puede hacer mi genoma para mí? 'Sino' ¿Qué pueden hacer nuestros genomas para todo el mundo? '"

La competencia puede resultar especialmente eficaz en la definición de diversas normas de investigación. Un reto de DREAM en curso, por ejemplo, hace un llamamiento a los competidores para refinar los modelos orientados a diferenciar mutaciones tumorales que son significativos de los que no son más que una coincidencia, una práctica conocida como llamada mutación. En la misma línea, Steven Brenner, de la Universidad de California, Berkeley, y John Muda de la Universidad de Maryland han organizado una serie de desafíos llamado Evaluación crítica de Genoma Interpretación (CAGI), que proporciona los conjuntos de datos genómicos para que los investigadores utilizan en el diseño de modelos para evaluar la importancia funcional de las diferencias genéticas. "No había habido buenas evaluaciones independientes de. . . [Los] tres docenas o más métodos para mirar una variante dada en el genoma ", dice Brenner. "El experimento CAGI fue diseñado para tratar de averiguar cuál era el estado de la técnica."

Después de haber recorrido unos 10 tales desafíos cada año durante los últimos tres años, Brenner dice que el mensaje final es, por desgracia, de que hay una sola manera de analizar los genomas suficiente en todas las circunstancias. En este sentido, los retos CAGI pueden proporcionar un importante servicio a la comunidad científica mediante la evaluación de lo bien que les fue a los predictores, y qué estrategia funciona mejor para un determinado conjunto de datos o que se trate. "No estamos buscando a ganadores y perdedores tanto como que estamos tratando de averiguar lo que pasó", dice Brenner.

Directamente desde la clínica

El uso cada vez más común de los registros electrónicos de salud (EHR) ha hecho un hallazgo previamente inaccesibles datos biomédicos disponibles para los investigadores. La Tecnología de la Información de la Salud de EE.UU. para la Salud Económica y Clínica (HiTech) Ley, promulgada en 2009, como parte del paquete de estímulo económico, destinó más de $ 20 mil millones en fondos federales para subsidiar la adopción de EHR durante la década siguiente, y Medicare y Medicaid ahora ofrecer incentivos monetarios a los proveedores de atención de la salud que utilizan los EHR.

"Hay un aumento real de la disponibilidad de datos electrónicos de salud, lo que hace que el momento adecuado para ser capaz de pensar acerca de cómo usar esos datos para hacer una mejor investigación", dice Rachael Fleurence, director de programa en la investigación de resultados centrados en el paciente Instituto (PCORI), que fue establecido por la protección del paciente de 2010 y Ley de Asistencia Asequible.

Muchas instituciones privadas de salud ahora están construyendo la infraestructura para optimizar el uso de sus datos. Permitiendo a los investigadores consultan a través de una serie de diferentes hospitales o proporcionar información básica sobre el tamaño de la muestra para una enfermedad o fármaco determinado hace que sea más fácil de evaluar si la obtención de los datos es la pena los engorrosos procesos de aprobación que intervienen en la obtención de datos y la investigación sobre la salud humana. "Cada vez más, están haciendo estos repositorios de información clínica disponible para la minería y hacer la investigación", dice John Brownstein, de la Escuela de Medicina de Harvard y el Hospital de Niños de Boston.

De muchas maneras, los investigadores están utilizando la tecnología para acercar la ciencia detrás hacia la forma en que solía ser, donde estaba presente muy vital, la conversación que viven entre mentes.-Nathan Pearson, Ingenio

Las compañías de seguros también están empezando a conocer los datos a los investigadores. Como parte de su Programa de Investigación sobre Genes, ambiente y salud (RPGEH), Kaiser Permanente, en colaboración con la Universidad de California, San Francisco, ha recogido y puesto a disposición de investigadores calificados, datos de más de 400.000 pacientes del norte de California, incluyendo el genotipado de la información y las mediciones de la longitud de los telómeros para algunos de los 200.000 clientes que han donado saliva o muestras de sangre. Y en febrero de 2014, Kaiser aportó la información genética y la salud de 78.000 personas con un promedio de edad de 63, un conjunto de datos desarrollada con UCSF llamados GERA (Epidemiología Genética de Investigación sobre el Envejecimiento), el Centro Nacional para la Base de Datos de Información Biotecnológica de genotipos y fenotipos (dbGaP).

La integración de datos de diferentes fuentes para el cuidado de la salud será un desafío permanente, a la que PCORI dedicó más de $ 100 millones en diciembre de 2013. La Red Nacional centrada en el paciente de Investigación Clínica (PCORnet) es una iniciativa nacional para construir y ampliar redes de pacientes y recoger los datos del paciente. Los fondos serán distribuidos a los 11 centros de salud, hospitales, y otras "redes de investigación de datos clínicos", así como 18 "Redes de investigación impulsado por el paciente", tales como grupos de defensa del paciente, con la intención de compartir los datos recopilados por cada grupo a través de toda la red. Institutos Nacionales de Salud (NIH) El director Francis Collins, quien es miembro de la junta de gobernadores de PCORI, promociona el potencial de PCORnet en un blog después de su anuncio público: "Esta iniciativa proporcionará una oportunidad sin precedentes para simplificar los ensayos clínicos, la autonomía de los pacientes, y construir una base sólida para la medicina personalizada ".

La participación del paciente

Los ciudadanos sirven como otra nueva fuente de abundantes datos biomédicos a disposición de los investigadores. Más de 400.000 clientes de personal-genómica biotecnología 23andMe han concedido empresa a los investigadores acceso a sus datos para estudiar la variación genómica subyacente ciertas enfermedades. Muchos de ellos también contribuyen los datos fenotípicos adicionales para apoyar la investigación. El sitio en el paciente redes PatientsLikeMe atrae de manera similar a miles de ciudadanos que están dispuestos a compartir sus datos con otros, con los investigadores, o incluso con todo el mundo, haciendo sus perfiles públicos.

"Esta es la cohorte más entusiasta que he visto en mi vida", dice Church. "[Ciudadanos] quieren participar. Ellos quieren ver cambios en su vida y la familia ".

Iglesia y psicólogo de Harvard Steven Pinker lanzó el PGP en 2005, cuando el proyecto de genoma humano sólo tenía cuatro años de edad y barata secuenciación estaba todavía lejos de la realidad. Hoy en día, la iniciativa basada en Boston tiene alrededor de 200 secuencias del genoma completo y 400 parciales disponibles para el estudio, y un adicional de 2.000 personas han contribuido rasgo de datos, registros de salud, y / o historias clínicas. Y en el último año y medio, PGPs paralelas han puesto en marcha en Canadá, el Reino Unido y Corea. Los datos están disponibles libremente para la investigación, y los participantes PGP debe primero pasar por un proceso de consentimiento extensa que incluye una prueba para demostrar que entienden los riesgos. (Consulte la sección "Consideraciones Éticas" a continuación.) Sin embargo, la Iglesia dice, el proyecto siempre ha atraído a más participantes de los necesarios.

Marty Tenenbaum de Palo Alto, Cáncer con sede en California Commons también está encontrando a los pacientes a ser una fuente de datos valiosos. En los últimos años, la compañía sin fines de lucro ha estado recogiendo datos directamente de los pacientes con cáncer en su tratamiento y biomarcadores. Con un par de miles en la base de datos hasta el momento, Tenenbaum se ha asociado ahora con los proveedores de atención de salud para obtener información más detallada. El objetivo a largo plazo, dice, es abrir la base de datos para bioestadísticos para buscar patrones, luego alimentar esa información a los pacientes y sus médicos para ayudar a informar a los diagnósticos y tratamientos. "Tenemos que encontrar una manera de capturar todo el aprendizaje que ocurre en el entorno oncológico comunidad", dice Tenenbaum.

Cada vez más grupos están aceptando los datos directamente de la comunidad de pacientes. Ingenuity invita a las personas en posesión de sus secuencias del genoma completo para subirlos a través del Genoma Comunidad Empowered, y el otoño pasado, Sage Bionetworks anunció BRIDGE, una plataforma basada en la nube que permite a los pacientes a donar la información sobre su salud y permiten su uso en la investigación abierta . "El objetivo es tratar de convertir las anécdotas que los ciudadanos tienen en señales reales de que los científicos puedan utilizar como conocimiento", dice el amigo, que espera ejecutar eventualmente desafíos en los datos recogidos de esta manera.

"Si se construye el sistema adecuado, los pacientes podían decir que cosas que no sabías que ibas a conseguir", dice Paul Wicks, un científico investigador en PatientsLikeMe. "Podría ser innovador."?